Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21972J3QN38 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms