Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20918J3QN17 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20918J3QN17 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms