Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Zfp616J3QN14 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Zfp616J3QN14 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Zfp616J3QN14 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Zfp616J3QN14 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Zfp616J3QN14 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Zfp616J3QN14 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms