Protein–RNA interactions for Protein: J3QN10

Gm16434, Predicted gene 16434, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16434J3QN10 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16434J3QN10 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16434J3QN10 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16434J3QN10 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16434J3QN10 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16434J3QN10 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm16434J3QN10 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm16434J3QN10 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm16434J3QN10 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm16434J3QN10 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm16434J3QN10 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm16434J3QN10 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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