Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp870J3QMA4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp870J3QMA4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms