Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm21818J3KMS6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm21818J3KMS6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm21818J3KMS6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21818J3KMS6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm21818J3KMS6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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