Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pabpc4lG5E8X2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms