Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pcf11G3X9Z4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcf11G3X9Z4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms