Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnmal2G3X9N3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnmal2G3X9N3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms