Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgef1G3X9K3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfgef1G3X9K3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms