Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-1G3UXB3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-1G3UXB3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-1G3UXB3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-1G3UXB3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx1-1G3UXB3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx1-1G3UXB3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx1-1G3UXB3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-1G3UXB3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms