Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r39G3UWE6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms