Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms