Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp32F8VPZ3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp32F8VPZ3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms