Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Farp1F8VPU2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms