Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms