Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm8220F6YKI2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms