Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Gm10378F6XQQ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm10378F6XQQ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm10378F6XQQ1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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