Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8247F6VRJ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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