Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhg1F6S200 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhg1F6S200 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms