Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610001J05RikF2Z3Y9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms