Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4E9QAP7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4E9QAP7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4E9QAP7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4E9QAP7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4E9QAP7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4E9QAP7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4E9QAP7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4E9QAP7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4E9QAP7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf4E9QAP7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms