Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd7E9Q9W7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms