Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp17lbE9Q9U0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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