Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh18E9Q9Q6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms