Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms