Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc141E9Q8Q6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms