Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms