Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga10E9Q6R1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms