Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nolc1E9Q5C9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nolc1E9Q5C9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms