Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms