Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms