Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup153E9Q3G8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms