Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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