Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
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