Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Myo5cE9Q1F5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Myo5cE9Q1F5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Myo5cE9Q1F5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo5cE9Q1F5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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