Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms