Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp4E9PYK3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms