Protein–RNA interactions for Protein: E9PYF4

Lmo7, LIM domain only 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo7E9PYF4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmo7E9PYF4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmo7E9PYF4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms