Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl3lE9PWZ3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms