Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30dE9PWL0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms