Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms