Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms