Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms