Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms