Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms