Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms