Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm4871D3Z0W7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm4871D3Z0W7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms