Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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