Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfia1B2RXQ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms